由于使用真空和液体加热使得旋转蒸发器成为实验室中的一个安全隐患。因此许多用户把附加的安全功能视为zui重要的条件，这也是生产厂家应该引起重视的。

所以目前市面上许多旋转蒸发器都配有安全-停止功能：当蒸发器遇到意外故障时会自动从电热器中退出。这就保证了样本不会受到破坏，也提高了无人值守时的工作安全性。可调节的终点位置识别能够避免蒸发器瓶下降的过深、从而也避免了蒸发器瓶的破损。

其他配件，例如特别防碎的蒸发器瓶，因为它有着特殊的防护涂层，或者加热池额外的防护罩等有关旋转蒸发器工作安全的装备。

温度控制也通过软件控制改进提高了，更加安全了：例如定义了安全温度，也就是加热池温度调节时不得超过的zui高温度值。

有些蒸发器系统还可以提供远程遥控进行控制。这就能够舒适的操作、控制安全罩内的蒸发器了，也进一步的提高了蒸发器工作的安全性。在传统的蒸馏设备中，被蒸馏的液体介质仅在蒸馏容器壁处才能接触到热源。这种接触可以导致过热、从而导致沸腾蒸发过程无法控制；这也就会给设备和人员带来安全风险。另外，过高的温度也会导致产品质量受到影响或者样品全部报废。通过旋转蒸发器的真空（低温状态下的沸腾、蒸发）和旋转（避免过热）则能够使稀释剂的清除过程*受控。在蒸发器瓶旋转原理的帮助下，蒸馏能力提高了好几倍，所采用的抽真空技术也能够在较低的温度条件下完成蒸馏。